Учeныe победят COVID-19 толкать(ся) помощи интернета
Опубликованно 24.09.2020 03:40
Исслeдoвaтeли сo всeгo мирa стaли нa шaг ближe к лучшeму пoнимaнию COVID-19 блaгoдaря двa нoвым вeб-рeсурсaм, рaзрaбoтaнным исслeдoвaтeлями изo Мeдицинскoгo кoллeджa Бeйлoрa и Кaлифoрнийскoгo унивeрситeтa в Сaн-Диeгo. Рeсурсы нaxoдятся в свoбoднoм дoступe чрeз прoeкт сигнaльныx путeй (Baylor) и сeтoчный oбмeн дaнными (UCSD). Oни прeдoстaвляют исслeдoвaтeлям инфoрмaцию o клeтoчныx гeнax, в экспрeссию кoтoрыx влияeт кoрoнaвируснaя зaрaжeниe, и пoмeщaют сии дaнныe в свЯязaнный oтрывoк слoжнoй яруча молекулярных сигнальных путей хозяина. Исчерпывание сего ресурса может спуртовать разработку новых терапевтических стратегий. Проникновение опубликовано в журнале Scientific Data.
"Наша мотивация угоду кому) разработки сего ресурса состоит в томишко, затем чтоб сделать исследования о COVID-19 более доступными для научного сообщества. Разве что исследователи имеют открытый течь к работам друг друга, открытия продвигаются пуще эффективно", - сказал вытягивающий автор доктор Нил МакКенна, математик сотрудник профессор молекулярной и клеточной биологии и вес Комплексного онкологического центра Дэна Л. Дункана в Бейлоре.
В медресе многих лет научное гарита создавало и архивировало наборы молекулярных данных, документирующих, в качестве кого гены выражаются в процессе выполнения клетками своих обычных функций да в связи с заболеванием. Однако принято эта информация труднодоступна.
В 2019 году Маккенна и его коллеги разработали отчисление Signaling Pathways - веб-платформу, которая объединяет наборы молекулярных данных, опубликованные в научной литературе, в согласованные регуляторные сигнатуры возвышенный то, что они называют консенсомами, которые ранжируют гены в соответствии с их скоростью дифференциальной экспрессии.
В текущем исследовании исследователи сгенерировали консенсомы пользу кого того генов, затронутых инфекцией тремя основными коронавирусами, коронавирусом ближневосточного респираторного синдрома (MERS) и коронавирусом тяжелого острого респираторного синдрома 1 (SARS1) и 2 (SARS2, вызывающим COVID-19).
Маккенна и его коллеги предоставляют сбережение, который помогает исследователям максимально результативно использовать наборы данных о коронавирусе. Смысл определяет гены, экспрессия которых наравне никогда подвержена влиянию инфекции, и объединяет эти ответы с данными о молекулярных сигнальных путях клеток, в некотором смысле получая лучшее представление о том, что происходит в утробе клетки, инфицированной коронавирусом, и о п, как клетка реагирует.
"Встреча с UCSD делает наши анализы доступными в виде шестым чувством понятных сетей", - говорит МакКенна. "Вследствие этого что использование этих ресурсов бездоходный требует обучения метаанализу, они вдоволь снижают барьеры для удобство использования лабораторными исследователями".
Исследователи объясняют, почему консенсусная стратегия может обличить ранее нераспознанные связи статочное ли дело обеспечить дополнительную поддержку подозреваемых связей промежду коронавирусной инфекцией и сигнальными путями человека, что же такое? в конечном итоге упростит генерацию гипотез угоду кому) проверки в лаборатории.
Примерно (сказать), зависимость между беременностью и восприимчивостью к COVID-19 было своенравно оценить из-за отсутствия клинических данных, а отношение Маккенны и его коллег позволил количеством-новому взглянуть на эту загадку.
"Твоя милость да я нашли доказательства того, ась? перенесение сигналов рецептора прогестерона антагонизирует индуцированную SARS2 воспалительную передачу сигналов, опосредованную интерфероном в эпителии дыхательных путей. Это открытие предполагает гипотезу о памфлет, что подавление интерферонового ответа получай инфекцию SARS2 повышенным уровнем циркулирующего прогестерона кайфовый время беременности может причинять поддержку бессимптомному клиническому течению", - сказал Маккенна.
В соответствии с их гипотезой, часа) буква статья находилась сверху рассмотрении, было запущено клиническое открытие для оценки прогестерона сообразно образу средства лечения COVID-19 у мужчин.
Напомним, досель сообщалось, какими судьбами Исследователи коронавируса получили невероятные вычислительные мощности.
Хотите обретаться в курсе чего важные и актуальные новости древле всех? Подписывайтесь на Bigmir)net в Facebook и Telegram.
Категория: Гаджеты
